倒了霉，一切官职皆被罢免。

如果一切到这里为止，那他或许可以脱离是非漩涡，或许就能安度余生了。

但问题是，到了崇祯二年秋冬之际，“己巳之变”发生，黄台吉亲率十万后金军破边墙而入，攻入大明京畿之地。

大明朝廷一片混乱，已经罢官闲置、正待罪通州的杨国栋，被惊慌失措的崇祯皇帝重新起用，并被临时任命为通州总兵。

再然后，后金军中的一路兵马进攻通州，被杨国栋击退，杨国柱守住了通州城，守住了这个百万漕粮囤积之地，为后来的朝廷反击保住了粮草。

这在当时一片溃败的形势下，是非常难得的功劳。

为此，崇祯皇帝还曾下旨褒奖，加封其为太子太傅，并且自掏腰包，从内帑银中拿钱赏银二十两。

但是，形势很快就又急转直下了。

袁崇焕率领辽军入关支援后，京畿形势本来已有所改观，只等各地勤王来援之兵抵达后，就有可能能转败为胜，但是对袁崇焕及其麾下辽军已心生不满和猜疑的崇祯皇帝，没有再给袁崇焕时间，而是听信传言，将其召入京师城内，就在御前将其抓捕下狱。

陪同觐见的祖大寿，受到惊吓，出城后，连夜带领辽军一路奔回了山海关，并放火烧了山海关，径直撤回了宁远。

此后，关内形势迅速恶化，各路援军来一个送一个，相继溃败。

直到崇祯皇帝起用了天启老臣孙承宗、天启老将杨肇基等人，才算渐渐稳住了局势。

崇祯三年正月，蓟辽总督刘策获罪被斩，杨肇基奉命率其所募山东勤王义勇出镇蓟州，一路往东收拢各部溃兵，率众入驻三屯营，但是很快就招致了后金军的进攻。

面对合围而来的后金军，严重缺粮兼且部下军心混乱的杨肇基，派人四出求救。

然而，面对敌人如此明显的围点打援之计，朝廷议而不决，各路勤王人马也不敢轻易前往。

最后响应其救援请求的，只有两路人马，其中一路是孙承宗派来的五百骑兵，而另外一路就是临时委任的通州总兵杨国栋。

因为杨肇基是杨国栋的老上官，且对杨国栋有提携推举之恩。

面对杨肇基的求救信使，杨国栋明知很危险，但却无法置之不理，于是带着在通州散尽家财募来的兵，押运一批粮草，一路急行，前去增援。

结果可想而知，刚一抵达“三屯营”城南景忠山附近，就遭遇了后金军的袭击，募来的兵一哄而散，杨国栋本人也死在了后金军追击下的乱军之中。